医院污水需要经过医疗污水处理设备过滤后使其无害化才可排放，云南医院污水处理设备在处理医院的污水，除一般生活污水外，还含有化学物质、放射性废水和病原体。因此，必须经过处理后才能排放，特别是肝炎等传染病病房排出来的污水，须经消毒后用云南医院污水处理设备过滤后才可排放。无集中式污水处理设备的医院，对有传染性的粪便，必须单独消毒使其无害化。
常用消毒剂有二氧化氯、漂白粉、液氯、次氯酸钠、臭氧。对含放射性同位素的污水，应按同位素处理要求处理。医院污水在处理过程中，沉淀的污泥含有大量的细菌、病毒和寄生虫卵，须经消毒（常用熟石灰消毒）或高温堆肥后方可用作肥料。
昆明医疗污水处理设备生产厂家对于医院污水的水质特点是含有大量的病原体──病菌、病毒和寄生虫卵。如结核病医院污水，每升可检出结核杆菌几十万至几百万个。医院污水还含有消毒剂、药剂、试剂等多种化学物质。利用放射性同位素医疗手段的医院的污水还含有放射性物质，这就需要经过云南污水处理设备净化过才可排放。
